Elles sont sept aujourd'hui, elles ont commencé à six. Dans Sonic the Hedgehog de 1991, il n'y a que six Émeraudes du Chaos à collecter, et ce compte reste celui de toute la ligne 8 bits : Sonic 1 et Sonic 2 sur Master System et Game Gear, Sonic Chaos, Sonic the Hedgehog Triple Trouble, Sonic Drift 2, Tails' Skypatrol. Le passage à sept date de Sonic the Hedgehog 2 sur Mega Drive, publié en novembre 1992, et ce nombre n'a plus bougé depuis. La compilation Sonic Origins, parue le 23 juin 2022, y a ajouté une séquence où une septième émeraude rejoint les six autres : un raccord narratif posé après coup, pas un changement de règle.
Leur apparence a longtemps flotté, en taille comme en découpe ; elle s'est stabilisée sur sept gemmes taillées en brillant, de la taille d'une paume, dans les couleurs vert, rouge, bleu, jaune, violet, cyan et blanc. Leur fonctionnement tient en une phrase : elles transforment la pensée en énergie, avec une polarité nette — l'amitié produit une énergie positive, la colère et la haine une énergie négative. Vidées, elles deviennent ternes et inertes ; on ne les rallume que par les pensées d'autrui, par les temples de Gaia, par un contact avec les Sol Emeralds, ou en les laissant se recharger seules.
Leur puissance croît avec le nombre, et la saga n'a donné qu'une seule échelle chiffrée de ce cumul : celle du canon Eclipse dans Sonic Adventure 2. Avec cinq émeraudes, l'arme peut détruire une grande ville ; avec six, une portion notable de la Lune ; avec les sept, des planètes entières. Elles s'attirent par ailleurs comme des aimants, ce qui permet à Tails de localiser Eggman à bord de la colonie spatiale ARK. Et après chaque usage collectif, elles se dispersent aux quatre coins du monde et retombent, ternes, dans des lieux à l'écart : la chasse recommence, et c'est le moteur de presque toute la série.
Leur rôle narratif, lui, a changé de nature en cours de route. Dans les jeux 2D des débuts, les émeraudes sont un bonus : les réunir donne la bonne fin, et rien de plus. À partir de Sonic Adventure en 1998, elles deviennent l'intrigue elle-même, le scénario les distribue, et les récupérer conditionne l'accès à la fin de l'histoire. Le collectible s'est fait scénario, et c'est l'un des grands basculements de la ludographie.
Leur origine, en revanche, n'est pas établie, et la série l'assume. Le récit le plus détaillé vient de Sonic Frontiers : des dizaines de milliers d'années plus tôt, un peuple technologiquement avancé, les Anciens, fuit sa planète devant une entité désignée comme The End en emportant sept gemmes qui alimentent les moteurs de ses vaisseaux. En passant près de la Terre, ces gemmes entrent en résonance avec la Master Emerald et détraquent la navigation, ce qui décide de l'atterrissage ; les Anciens s'en serviront ensuite pour créer le Cyber Espace et les Titans. Le point mérite d'être souligné parce qu'il est souvent mal rapporté : les Anciens se servent des émeraudes, rien n'indique qu'ils les aient fabriquées.
Le second grand récit d'origine est celui du clan Knuckles, il y a plus de trois mille ans. Les sept émeraudes reposaient alors sur sept piliers de pierre autour de la Master Emerald, à l'Autel de l'Émeraude, dans un sanctuaire habité par une colonie de Chao et protégé par une divinité aquatique, Chaos. Le chef Pachacamac lança un raid pour s'en emparer ; sa fille Tikal s'interposa, en vain. Chaos utilisa les gemmes pour devenir Perfect Chaos et anéantit la civilisation du clan, avant d'être scellé dans la Master Emerald. C'est de là que vient le nom : on appela ces pierres les Émeraudes du Chaos parce qu'on estimait qu'elles apportaient le chaos.
Un demi-siècle avant le présent de la série, le professeur Gerald Robotnik les étudia à bord de l'ARK dans le cadre du Projet Shadow. Ces recherches produisirent les Chaos Drives et révélèrent qu'un robot ancien, le Gizoid, réagissait aux gemmes : une émeraude installée en lui déclencha un saccage qui détruisit une grande partie de la station. Il existe enfin des émeraudes artificielles, que Tails sait fabriquer : elles reproduisent la longueur d'onde des originales avec moins de puissance et permettent même de déclencher un Chaos Control — au prix d'un épuisement qui laisse à peine debout.